| 根据审计工作的需要，巩义市审计局内设五科两室，分别是办公室、财政审计科、企业审计科、行政事业审计科、法制科、投资审计科和经济责任审计办公室，其主要工作职责如下： |
 一、办公室：处理审计局的日常事务和做好后勤工作。 |
| 二、财政审计科：对本级财政预算执行情况及各镇财政预决算的真实性、合法性进行审计，并对行政事业单位财政财务收支进行延伸审计。 |
| 三、企业审计科：对市属国有企业、国有资产占控股地位或主导地位的股份制企业，联营企业、中外合资合作企业及金融单位的资产、负债和损益情况的真实性、合法性和效益性依法进行审计监督。 |
| 四、行政事业审计科：对全市行政、事业单位财政财务收支情况进行审计和审计调查，完成领导交办的其它工作。 |
| 五，法制科：组织政治学习，抓好局里的普法教育、依法治市和执法证的管理工作，并且定期对被审计单位进行回访。 |
| 六、投资审计科：．对全市基本建设投资的真实性、合法性进行审计监督；对建设管理部门、施工单位、设计、监督单位的财务收支进行审计，完成临时交办的其他任务。 |
| 七、经济责任审计办公室：对市党政正职、国有企业及国有资产占控股地位或主导地位的企业法人代表进行任职期间的经济责任进行审计。
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